2008/10/24

Time to working for performance bonus

年終將近,08年轉眼也到了Q4的時節。難怪最近在新竹街口越來越常看到警察了,特別是在轉角附近,前幾天我福至心靈沒有在東光路跟忠孝路交叉口紅燈右轉,綠燈才彎過去時就看到幾個警察在那邊作業績,那邊我早看過好幾次警察在那邊等著抓違規了。

更別提今天在新竹中學的車道邊看到一對男女被警察攔下;然後光復路就更刺激了。工研院門口跟對面都有辛勤的警察叔叔伯伯在工作,真是欽佩。這樣的密度跟前幾個月房東太太跟我抱怨說她被開了好多單但我都沒看到警察的情況爭是雲泥之別阿,何況她說她是半夜被抓的......,違規項目是騎車沒戴安全帽阿、紅燈右轉之類的,囧。總之時機歹歹,各位要多多遵守交通規則阿~

2008/10/21

Take a rough look in Sinica

前幾天拉了學弟帶我去參觀中央研究院,在wiki中查到"Academia Sinica"這個詞的意思在拉丁文中就是"Chinese Academy",總之是國家級的研究機構。

大部分建築風格都相當的樸實保守,在一棟棟的研究大樓間散落著些綠色的樹叢;在接近中心的地帶有條人工運河穿過,整體環境感覺上還算是優美,但我開始羨慕起可以把實驗室蓋成前衛建築的國家了。由於懶得處理換證的問題,就沒有去生醫所內閒逛了,真可惜。/_\

路過看到的中研院僱員,雖然服裝樸素但看起來還是台北等級的樸素;但看這附近跟博愛校區有得拼的荒涼程度,住家環境看來很有眷村感覺的年代感,並且離捷運站都非常遙遠,套句我學弟說的"通常會在這邊作研究的就是不計較這種環境啦"。

逛了逛生化所旁邊的生科圖書館,感覺得出有學校級圖書館等級的藏書量。最近館內有個叫末代企鵝的展覽,只是我對穿著古代服裝在尋求滅亡前最後歡樂的企鵝們缺乏共鳴。最後在老派但不失排場的咖啡廳吃午餐,我點了蒜味牛排焗飯,但牛排弄得太熟了= =,幸好有八折的員工價,不然這頓就會顯得非常的貴了。另外可惜今天沒拍到照片,草原中還有朱銘的藝術品耶。

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P.S.回新竹時差點要在地下街買了台去年鋼彈00裡面的德天使鋼彈(HG00 Gundam Virtue),新大陸原住民的山積特價比之前地下街的通常價打了九折耶.......幸好今天在網拍上看到了更便宜的價格XD。

2008/10/12

Over 1000 times visit

前幾天剛注意到sitemeter的計數器突破一千了,留篇文章紀念一下^^。雖然觀察一下這一年來發表的文章跟當初的預期有點落差,希望自己寫的偏學術性或做些嚴肅的文章質跟量都低於我的預期~哈哈,不過至少有認真的試圖去組織文字成一個完整的段落,並且有盡量維持住一星期大概一到二篇的文章進度,隨時手上都會有幾篇草稿等著要修改發佈的狀態。

另外觀察了一下who's.amung.us的記錄,最近開始出現了許多訪客,有來自中國各地的,有來自美國的,不過最近竟然也出現馬來西亞的,看來真是越來越國際化了@@",看流量來源都是google找到的居多,而且直連首頁的佔大多數,真想不透原因。

最近報告進度後被指導教授大幅的"修正",我這周除了要在Jounral Club報告外還要繳交現在沒寫幾個字的研究成果跟研究計畫出去阿(抱頭),希望維持產量能夠順利的度過(笑)。

2008/10/10

Using sequence similarity and protein interactions to predict enzyme function

之前幾週選了篇最近在BMC 生物資訊期刊上剛發表的"藉由序列相似度以及蛋白質間的交互作用來預測酵素功能"的論文給學弟報告,今天注意看才發現竟然是Highly accessed的論文,真是太有眼光了XD。

這篇文章的論點建築在如果某個蛋白質的同源蛋白質跟有類似交互作用的同伴反應的話,就會表現出有相近的功能的假設上;也就是說,兩條有相當相似功能的蛋白質要是有共同的交互作用應該要共享一樣的EC前三碼。我覺得這假設一眼看起來是頗直觀也看似挺有道理的,同源的蛋白質有較高的可能有近似的功能;而且兩兩蛋白質交互作用的同伴都類似的話,他們可能是運作同樣功能也很有可能吧,但這篇論文好像凹了十個月才通過審查被接受=..=||,大概看了一下可能是因為結果只有在部分情況會比直接跑blast作序列比對好的關係吧。

BURGER KING is return!

之前幾個月在火車站附近隨著大樓整修消失的漢堡王,最近又重新開幕了,稍微小挪一下位置,離甜甜圈先生更近了。現在終於不用再為了買華堡跑到大老遠的園區山上囉。

大學時在吃過華堡後,我開始覺得漢堡王的漢堡比藍藍路的有更實惠的感覺,而買一送一的華堡的特惠,在我心目中更是一口氣超越了大麥克的存在,不過藍藍路因為有很豐富的附餐選擇(甜品跟奶昔阿)還是很有吸引力啦。另外漢堡王在台南的第一個據點,竟然就選在我家的對面,使得連我爸有一陣子都愛上吃漢堡王,可惜現在買一送一的特惠要用鑰匙圈才能得到了。

最近從實驗室博班學姐的發言,我推測新竹這間漢堡王可能有八年以上的歷史了,感覺歷史真悠久呢。

2008/09/29

"Sweet Sweet Victory......"

標題是今天下午在躲颱風時看海綿寶寶(SpongeBob SquarePants)殺時間聽到的歌詞,是海綿寶寶他們組成的樂團在超泡盃表演的音樂,覺得有股很老派的樂團風味,於是便查了一下找到作曲跟原唱都是David Glen Eisley,這首歌在youtube上隨便都可以找到幾個版本來聽,像是這個版本,還有老外在Yahoo知識+發問等等。海綿寶寶好像在高中生之間相當的流行的樣子,真妙@@。

但說到米國動畫,我還是比較喜歡最近剛開始在看的南方公園(最近弄到來源看完了第十季),劇中的演出跟劇本相當的努力挖苦美國文化現象跟嘲諷時事,我覺得還挺有娛樂性的,缺點大概就是對白太(消音)吧。

Moose finally get his first 20-win season!

總是跟單季20勝、賽揚獎、單季MVP與完全比賽這些成就擦身而過的Mr. Almost,今天終於告別悲情的拿下了生涯首次的單季20勝球季,並且作為Yankees今年球季的最後一日,也勉強算是個可以撫慰人心的句點了。

但這大概是這個球季少數值得慶賀的事情吧/__\,另一件馬上能想到值得慶賀的事是今年的牛棚使用比去年有了許多進步吧,剩下的大多都只能用orz聊表心意......

See you at New Yankee Stadium next year orz.....

2008/09/25

Take a drive on Road Garden around Tienwei

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這是田尾公路花園上某間花店銷售中的睡蓮,覺得午前盛開的氣質很美就拍了下來,很美吧。已經大概是幾週前跑去彰化的了,不過一直沒有空把這件事記下來,看來這個月很快又要面臨網誌產量突破新低的危機了,但反過來說這也是研究在趕進度的表徵吧(誤)。

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同間花店內路邊的貓頭鷹石雕;還有他們花店養的貓,很受店員喜歡也不怕生人,似乎可以任意的撫摸。在田間小徑中隨意亂開碰巧路過波斯菊田,就下去順手照了幾張,花海感覺挺浪漫的。

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田尾公路花園給我的印象大致上就像是沿途左右都是花店花店花店花店,而且是量販店,店裡架子上整齊的排滿各種植物的盆栽,感覺挺商業化的,就像是民家改建的假日花市那樣吧,雖然每間花店似乎都有自己的特色,但我沒有很明顯的感受到區別,我跟植物不熟可能也是原因吧~呵呵;偶爾路上穿插幾間石頭造景或是賣樹的異數,離市區幹道比較遠的地方才開始有花田,或是上面照片作為背景一角的溫室。

就這樣在田尾繞過一圈後又跑去吃附近的北斗肉圓,雖然餡料多了竹筍碎塊不過我覺得普普,還是南部的肉圓好吃(L)。

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P.S. 說到花海就讓我想到台南在軍醫院往糖廠附近的路上,休耕期間也是種滿波斯菊或是向日葵之類的花海,挺美的~

IF of Bioinformatics in 2007JCR

今天順手翻了一下今年的Jounral Citation Reports結果,目前在數學與計算生物學(MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY)這個分類裡面的龍頭還是PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY提升到了6.2(去年是4.9),但我覺得這期刊有點不太好讀@@",另外BIOINFORMATICS又破了5.0(去年接近4.9),看來從去年重摔後正在微幅上漲;而BMC BIOINFORMATICS接近3.5(去年約3.6),不會就穩定在那邊吧= =;,不過在裡排名從4/26向前進到第三名,另外到現在ACM跟IEEE合辦的計算生物學期刊IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 好像還是沒被收進這個分類內XD。

最後大概看了一下我們研究所博士班畢業需要的點數至少是2.5的樣子,聽起來如果目標是拿到文憑的話,把目標放在發表兩篇文章在BIOSYSYEMS(1.646)應該就綽綽有餘了(汗)。

2008/09/04

NUMB3RS: "We all use math every day, ......"

最近開始有系統的開始看AXN的數字搜查線(NUMB3RS),之前只是剛好看電視碰巧轉台看到才會順便看一下,是個加州科學大學的英俊捲髮天才數學教授應用自己的專長幫FBI的哥哥解決調查上的各種難題的故事,包含應用數學理論預測犯案時間或是縮小搜查範圍,甚至預測山上的逃亡路線或是狙擊手射擊的選擇位置,幾乎無所不包,像是之前流行的決勝21點原著小說裡面提及的算牌技術跟那個知名的三選一遊戲,另外像棒球很熱門的分析賽伯計量學這些也有提到。有時候當在推導那些定理跟那些方程式,就像裡面的名狙擊手對主角的讚嘆,像"巫毒"(Voodoo)一樣,有時他的研究物理的學院導師跟美貌的數學助理也會提供些協助。並且他們為了確保裡面提及的數學理論無誤劇組還聘請了許多數學家作為顧問,詳細的介紹可以看看wiki,當然在youtube上也找得到節目的trailer

對於一個把數學當工具的研究所學生,當劇情中提到一些會用到機器學習、型樣識別、資料探勘等等理論的時候,會感到有點興奮跟熟悉,說起來我好像越來越不像以前待過生科系的學生了XD

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另外提一下風軟的翻譯品質實在不太穩定,有時候翻不出來就整段空白裝傻,不然就是把躲人隊翻成躲避球隊等等,感覺分工的團員的語言水準沒有很一致=..=。